Mlýnský potok pramení v západní části Železných hor. Pramen se nalézá v blízkosti tvrziště Stoupec. Mlynský potok má dva prameny, jeden pramen se nalézá na špatně přístupné mýtině a druhý pramen vyvěrá ze studánky viz foto. Potok ústí mezi obcí Ledec a Chrtníky do Struhy. Tvrz Stoupec byla vybudována jíž v období Karla IV jako strážní stanoviště chránící Trstenickou stezku.